Sérgio Gomes desenvolveu a sua atividade profissional de arqueólogo, no âmbito de arqueologia empresarial, em articulação com a atividade de pesquisa académica, financiada por bolsas individuais da FCT. Estas atividades permitiram-lhe consolidar a sua carreira de investigação no quadro das práticas científicas e culturais, designadamente na área da arqueologia e do património cultural.

Os diferentes projetos em que tem participado permitiram-lhe desenvolver duas áreas de pesquisa: o estudo da Pré-história Recente de três regiões, o Alto Douro, o Médio Vouga e o Baixo Alentejo; o estudo da história e da teoria da arqueologia enquanto disciplina científica e prática social. Desenvolvendo estas áreas de pesquisa, pretende contribuir para: o conhecimento de sequências regionais culturais da Pré-história da Península Ibérica; a discussão das possibilidades de compreensão da diferença cultural das comunidades da Pré-história Recente; e a consolidação da arqueologia enquanto uma área do saber comprometida com os desafios éticos do mundo contemporâneo.